Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cnn2Q08093 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms