Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MestQ07646 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MestQ07646 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MestQ07646 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MestQ07646 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MestQ07646 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MestQ07646 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MestQ07646 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MestQ07646 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MestQ07646 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MestQ07646 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MestQ07646 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MestQ07646 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MestQ07646 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MestQ07646 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MestQ07646 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MestQ07646 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MestQ07646 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MestQ07646 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MestQ07646 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MestQ07646 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms