Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cntn3Q07409 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntn3Q07409 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms