Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gdf3Q07104 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gdf3Q07104 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms