Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp2Q06649 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms