Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prrx2Q06348 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrx2Q06348 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms