Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thbs3Q05895 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs3Q05895 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms