Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rcn1Q05186 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcn1Q05186 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms