Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox12Q04890 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox12Q04890 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms