Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox8Q04886 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox8Q04886 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms