Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Emx2Q04744 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Emx2Q04744 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms