Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tff2Q03404 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tff2Q03404 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms