Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx2Q03358 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx2Q03358 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms