Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb5Q02739 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb5Q02739 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms