Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nhlh1Q02576 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlh1Q02576 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh1Q02576 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms