Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snai1Q02085 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snai1Q02085 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snai1Q02085 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms