Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacna1cQ01815 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1cQ01815 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms