Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp1Q00915 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp1Q00915 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms