Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cds1P98191 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds1P98191 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds1P98191 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cds1P98191 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cds1P98191 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms