Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba2P98084 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba2P98084 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba2P98084 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba2P98084 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms