Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scn1bP97952 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn1bP97952 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms