Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata5P97489 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata5P97489 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata5P97489 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gata5P97489 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gata5P97489 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms