Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad4P97471 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad4P97471 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad4P97471 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad4P97471 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms