Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx3-1P97436 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nkx3-1P97436 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms