Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx1P81068 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx1P81068 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx1P81068 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx1P81068 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx1P81068 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx1P81068 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms