Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx4P70452 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx4P70452 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx4P70452 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms