Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SeboxP70368 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SeboxP70368 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SeboxP70368 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SeboxP70368 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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