Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smad1P70340 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smad1P70340 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smad1P70340 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms