Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprvP70289 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprvP70289 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprvP70289 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprvP70289 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprvP70289 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprvP70289 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprvP70289 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprvP70289 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprvP70289 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprvP70289 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprvP70289 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms