Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp7P70280 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp7P70280 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms