Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Surf6P70279 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf6P70279 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms