Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13P70217 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13P70217 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 314.3 ms