Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3aP63011 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms