Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27aP62983 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27aP62983 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms