Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Crabp1P62965 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crabp1P62965 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms