Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl30P62889 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl30P62889 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl30P62889 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl30P62889 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl30P62889 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl30P62889 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl30P62889 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl30P62889 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl30P62889 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl30P62889 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl30P62889 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl30P62889 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms