Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab3cP62823 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms