Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tbpl1P62340 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tbpl1P62340 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tbpl1P62340 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tbpl1P62340 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tbpl1P62340 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tbpl1P62340 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tbpl1P62340 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbpl1P62340 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms