Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lmo4P61969 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lmo4P61969 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms