Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmem258P61166 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem258P61166 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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