Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b6P59708 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b6P59708 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms