Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hps5P59438 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hps5P59438 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps5P59438 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps5P59438 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms