Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Nphp4P59240 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms