Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm2P58774 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms