Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klf16P58334 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klf16P58334 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klf16P58334 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf16P58334 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf16P58334 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf16P58334 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klf16P58334 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms