Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpa1P57784 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpa1P57784 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms