Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gsc2P56916 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms