Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gp1bbP56400 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gp1bbP56400 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gp1bbP56400 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gp1bbP56400 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gp1bbP56400 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gp1bbP56400 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms