Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp5P56399 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp5P56399 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp5P56399 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp5P56399 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp5P56399 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp5P56399 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp5P56399 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms