Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
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CartptP56388 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CartptP56388 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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CartptP56388 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CartptP56388 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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CartptP56388 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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CartptP56388 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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CartptP56388 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CartptP56388 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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CartptP56388 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CartptP56388 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CartptP56388 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CartptP56388 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CartptP56388 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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CartptP56388 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CartptP56388 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CartptP56388 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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CartptP56388 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CartptP56388 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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CartptP56388 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CartptP56388 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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CartptP56388 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CartptP56388 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CartptP56388 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CartptP56388 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CartptP56388 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CartptP56388 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CartptP56388 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CartptP56388 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CartptP56388 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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CartptP56388 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CartptP56388 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms